Pages

Metode sinteze i oksidacije piridilporfirina
Metode sinteze i oksidacije piridilporfirina
Pegi Pavletić
Porfirini su organski spojevi koji se mogu koristiti kao fotoosjetljivi spojevi (PS) u fotodinamičkoj terapiji (PDT). PDT uključuje administraciju PS-a u tijelo, gdje se isti lokalizira u tumorskom tkivu te, nakon osvjetljavanja svjetlošću određene valne duljine, uzrokuje odumiranje tumorskog tkiva. Najčešća metoda sinteze porfirina u našem laboratoriju je modificirana Adler- Longo reakcija koja se relativno jednostavno izvodi, brza je i daje nečistoće koje se mogu pročistiti...
Međumolekularni prijenos supstrata unutar kratkotrajnog protein-protein kompleksa: D-gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza i L-laktat dehidrogenaza
Međumolekularni prijenos supstrata unutar kratkotrajnog protein-protein kompleksa: D-gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza i L-laktat dehidrogenaza
Filip Petrić
D-Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH) i laktat dehidrogenaza (LDH) tvore kompleks koji regulira metaboličke puteve. Međutim, mehanizam kojim se to odvija nije poznat. U ovom radu smo analizirali mogućnost prijenosa NADH sa GAPDH-NADH kompleksa na LDH izozime koristeći enzime iz raznih stanica. Proučavanje enzimske kinetike i vezanja NADH je pokazalo kako LDH može koristiti GAPDH-NADH kompleks kao supstrat. Aktivnost LDH sa GAPDHNADH kompleksom je provjerena sa LDH antitijelima...
Mikrodelecije Y kromosoma u neplodnih muškaraca
Mikrodelecije Y kromosoma u neplodnih muškaraca
Lucija Mustač
Y kromosom svojom strukturom i genima koje sadržava, s naglaskom na gene iz područja AZF (faktora azoospermije) regije, ima ključnu ulogu u kontroli i provođenju normalnog procesa spermatogeneze. U slučaju delecija u navedenoj regiji dolazi do poremećaja u procesu spermatogeneze. Najteži poremećaj koji iz toga proizlazi je neplodnost muškarca. Ona se javlja u najviše zabilježenih slučajeva, iako postoje mnogi uzroci tog poremećaja. Također, postoje značajne varijacije u...
Mjerenje stvaranja singletnog kisika upotrebom fotodegradacijske metode
Mjerenje stvaranja singletnog kisika upotrebom fotodegradacijske metode
Rafaela Pokrajac
Fotodinamička terapija (PDT) suvremen je pristup liječenju tumora koji se oslanja na interakciju svjetlosti određene valne duljine s molekulom fotosenzibilizatora koja iz svog pobuđenog tripletnog stanja pobuđuje molekularni kisik na više energetsko stanje. U tom procesu nastaje visoko reaktivni singletni kisik. Terapijski efekt postiže se lokaliziranim citotoksičnim djelovanjem singletnog kisika na tumorsko tkivo. ROS-ovi poput singletnog kisika razaraju proteine, lipide, nukleinske...
Modelling the schizophrenia-related aggregation of NPAS3 and CRMP1 in neuroblastoma cells
Modelling the schizophrenia-related aggregation of NPAS3 and CRMP1 in neuroblastoma cells
Bobana Samardžija
Chronic mental illness affects millions of people every year, while its origins and mechanisms remain unclear. Since symptoms of neurodegenerative and mental disorders are similar, our research focuses on protein aggregation. Protein aggregation changes the structure of protein and can cause loss of function or gain of a novel toxic function. There are several proteins characterized as aggregating in mental illnesses, of which we focused on Collapsin Response Mediator Protein 1 (CRMP1) and...
Molecular Dynamics in Studies of Activity Modulators of γ-Secretase as Drug Candidates for Alzheimer's Disease
Molecular Dynamics in Studies of Activity Modulators of γ-Secretase as Drug Candidates for Alzheimer's Disease
Katarina Vrbnjak
Background: Alzheimer's disease is the most expensive disease for healthcare providers in developed countries in the 21st century, and the most lucrative market for the pharmaceutical industry. Changes in the activity of the membrane embedded protease γ-secretase can result in a decreased clearance of amyloid proteins and the development of Alzheimer's disease. We analyzed the catalytic mechanism of γ-secretase using some of the best known drug candidates; semagacestat, DAPT, avagacestat,...
Molecular dynamics studies of DNA-DNA methyltransferase 1 complex structural changes during binding
Molecular dynamics studies of DNA-DNA methyltransferase 1 complex structural changes during binding
Rajna Koren
Background: DNA methylation is the first and most enduring epigenetic mark, that acts as a fundamental mechanism in functional organization of human genome. Inhibitors and activators of DNA methylation can be used for genetic reprogramming of differentiated cells, or as tools for gene expression analysis. DNA substrates with guanine replaced by inosine at the target site showed an amazing 30 fold activation in methylation activity. Activation of mammalian DNA methyltransferase (Dnmt1) by...
Molecular mechanics and molecular synamics of dna methylation regulation in human cells
Molecular mechanics and molecular synamics of dna methylation regulation in human cells
Ivica Odorčić
Significance: DNA methylation is a fundamental mechanism of functional organization of the human genome. The inhibitors and activators of DNA methylation can be used in tissue engineering by cellular reprogramming and in analysis of functional organization of human genome. Numerous studies have described design of inhibitors of DNA methylation but no study so far has described design of activators of DNA methylation. In this study we analyze unusual 30 fold increase in activity of human...
Molekularna dinamika u analizi koraka u katalitičkom ciklusu gama-sekretaze: potraga za novim strategijama za dizajn lijekova za Alzheimerovu bolest
Molekularna dinamika u analizi koraka u katalitičkom ciklusu gama-sekretaze: potraga za novim strategijama za dizajn lijekova za Alzheimerovu bolest
Lucija Ostojić
Background: Alzheimer’s disease is the most common type of dementia, and currently the biggest financial burden for health care providers in developed countries. γ-secretase is a large membrane embedded protease and a major target in drug development efforts based on over 250 mutations in its structure that can cause the disease. We used all-atom and coarse-grained molecular dynamic studies to describe the structural changes in the catalytic cycle of γ-secretase. Results: Adaptive...
Molekularne osnove šizofrenije
Molekularne osnove šizofrenije
Sanja Mikašinović
Šizofrenija je složeni neuropsihijatrijski poremećaj koji pogađa oko 1% populacije. Karakterizira ju prisutnost raznovrsnih i ozbiljnih simptoma koji se najčešće pojavljuju u ranoj odrasloj dobi, te narušavaju kvalitetu života pacijenata i njihovih obitelji. Unatoč dugotrajnom istraživanju neurobiološke osnove šizofrenije, jedinstvena patofiziologija bolesti i dalje nije definirana. S obzirom na slabo poznavanje temeljnih molekularnih mehanizama poremećaja, liječenje trenutno...
Molekularni mehanizmi depresije
Molekularni mehanizmi depresije
Lea Radošević
Depresija je danas vrlo raširena bolest od koje obolijevaju i muškarci i žene, neovisno o dobi. Iz tog se razloga puno ulaže u istraživanja ove bolesti te razvoj prikladnog lijeka, a s obzirom da je riječ o složenom poremećaju, postoji puno različitih hipoteza koje nastoje objasniti molekularne mehanizme bolesti. Jedna od glavnih jest tzv. “monoaminska hipoteza”, prema kojoj se kao glavni uzrok depresije smatra smanjena količina i aktivnost monoamina u određenim regijama...
Monoklonska protutijela u imunoterapiji raka
Monoklonska protutijela u imunoterapiji raka
Karla Selar
Monoklonska protutijela predstavljaju obećavajuću i brzo rastuću vrstu bioloških lijekova koji su jedni od najprodavanijih na tržištu. Dio su imunoterapije, koja je uz kemoterapiju, operaciju i radijaciju jedan od temeljnih načina liječenja raka. Imunoterapija se počela razvijati zahvaljujući napretku u razumijevanju odnosa raka i imunosnog sustava, a samim time slijedio je i razvoj monoklonskih protutijela. Protutijela su glikoproteini koji u organizmu nastaju iz B-stanica i...

Pages