prikaz prve stranice dokumenta Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma
No public access
master's thesis
Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma
2016. urn:nbn:hr:193:417742
Kocijan, Tea
University of Rijeka
Faculty of Biotechnology and Drug Development

Cite this document

Kocijan, T. (2016). Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma (Master's thesis). Rijeka: University of Rijeka. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

Kocijan, Tea. "Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma." Master's thesis, University of Rijeka, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

Kocijan, Tea. "Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma." Master's thesis, University of Rijeka, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

Kocijan, T. (2016). 'Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma', Master's thesis, University of Rijeka, accessed 16 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

Kocijan T. Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma [Master's thesis]. Rijeka: University of Rijeka; 2016 [cited 2024 November 16] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

T. Kocijan, "Komparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma", Master's thesis, University of Rijeka, Rijeka, 2016. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:193:417742

Please login to the repository to save this object to your list.
Metadata
TitleKomparativna proteomska analiza Staphylococcus aureus spp. sa svojstvom formiranja biofilma
Title (english)Comparative proteomic analysis of biofilm forming Staphylococcis aureus spp.
AuthorTea Kocijan
MentorAlessio Soggiu (mentor)
MBZ: AS134
Committee memberAlessio Soggiu (predsjednik povjerenstva)
Committee memberMirela Sedić (član povjerenstva)
Committee memberĐuro Josić (član povjerenstva)
GranterUniversity of Rijeka
(Faculty of Biotechnology and Drug Development)
Rijeka
Defense date and country2016-07-28, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOTECHNICAL SCIENCES
Biotechnology
Abstract
Staphylococcus aureus je ljudski i životinjski oportunistički pathogen koji je uzrok velikog broja bolesti, uključujući trovanje hranom. Jedan od mogućih načina diseminacije ove bakterije je putem hrane kontaminirane u procesu obrađivanja od strane zaražene osobe. Također, poznato je da S. aureus formira biofilm na različitim materijalima koji se upotrebljavaju u obradi hrane i rezistentan je na većinu dezinfekcijskih sredstava. Cilj ovog rada je istražiti mehanizme formiranja biofilma zajedničke cijeloj vrsti S. aureus uspoređujući proteinsku ekspresiju planktonskih i sesilnih oblika ove bakterije. U ovom radu upotrebljen je proteomski pristup istraživanju proteina uključenih u mehanizam formiranja biofilma koji su zajednički cijeloj vrsti S. aureus. Za separaciju proteina uzoraka i identifikaciju diferencijalno eksprimiranih proteina između planktonskih i sesilnih formi ove bakterije korištena je metodologija bazirana na dvodimenzionalnoj gel elektroforezi u kombinaciji sa MALDI-TOF masenom spektrometrijom. Ukupno šest sojeva bakterije je analizirano u dva eksperimenta. Sojevi su se međusobno razlikovali u kapacitetu formiranja biofilma budući da je to doprinjelo identificiranju mehanizma specifičnog za cijelu vrstu. U dva eksperimenta je pronađeno sedam proteina diferencijalno eksprimiranih između planktonskih i sesilnih formi bakterije S. aureus koji su zatim identificirani MALDI-TOF MS tehnikom. Među identificiranim proteinima, pojačanu ekspresiju u sesilnim stanicama imali su fosfofruktokinaza, alkohol dehidrogenaza, dugolančana-masna-kiaselina-CoA-ligaza, univerzalni stres protein i protuprijenosna podjedinica mnhE2, dok su fosforibozilglicinamid formiltransferaza i acetat kinaza bili pojačano eksprimirani u planktonsim stanicama. Ovi rezultati upućuju na činjenicu da bi mehanizam formiranja biofilma mogao biti povezan se pojačanom aktivnošću glikolize i sinteze masnih kiselina, te smanjenom sintezom purina.
Abstract (english)
Staphylococcus aureus is an opportunistic human and animal pathogen that causes a wide range of diseases, including food poisoning. S. aureus is known to form biofilm on various materials used in food processing and exhibits resistance to many commonly used antimicrobials. The aim of this work is to investigate mechanisms of biofilm formation representative for the whole S. aureus specie by identifying proteins differentially expressed in planktonic and sessile forms. In this work, proteomic approach was applied to study proteins involved in species specific biofilm forming mechanism of S. aureus. Differential protein expression between planktonic and sessile forms of the bacterium was investigated using combined 2D electrophoretic separation and MALDI-TOF MS identification of designated spots. Six strains in total were used for the analysis. The strains differed in their biofilm forming capacity as the detection of common mechanisms between differently efficient biofilm producers contributed to avoiding strain specificity. Seven proteins were found to be expressed differentially between sessile and planktonic cells in the two experiments. Proteins found upregulated in the sessile cells in both experiments were ATP-dependent 6-phosphofructokinase, alcohol dehydrogenase, putative long chain-fatty acid CoA ligase, putative universal stress protein and putative antiporter subunit mnhE2, whereas phosphorybosylglycinamide formyltransferase and acetate kinase were consistently downregulated. These results indicate that the biofilm forming mechanism may be dependent on an upregulation of glucose and lipid metabolism pathways, and reduction in purine biosynthesis.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:193:417742
Study programmeTitle: Biotechnology in medicine
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra biotehnologije u medicini (magistar/magistra biotehnologije u medicini)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2016-10-21 11:52:29